Amasyalıdır. Kâdı Burhân devri ricâlinden Seydî Hüsâm evlâd-ı kirâmından es-Seyyid Ahmed bin es-Seyyid Abdulkerîm bin es-Seyyid Abdulkâdir bin Seydî Hüsâmeddîn Hüseyin el-Fergânî el-Kubâvî mahdûmudur. Hazreti Hüseyin bin Alî bin Ebi Talib’e kadar nesebi aşağıda pederinin amcası es-Seyyid Hüsâmeddîn Hüseyin Kubâvî tercemesinde gelir.
Seydî Hüsâmzâdelikle meşhûr olan Emîr Ca’fer Çelebi yedi emîrlerden biridir. Amasya’da Koca Emîr İbrâhim Efendi’den tahsîl-i ulûm edib vâlî Şehzâde Sultân Ahmed mukarreblerinden ve Mîr Gıyâseddîn Şîrâzî musâhiblerinden oldu.
918’de Sultân Selîm Han’ın cülûsu ve Sultân Ahmed’in i’dâmı üzerine gözden düşüp 923’de Mîr Gıyâs’ın kazâ’en fevtinde bir müddet menkûb oldu. 927’de nakîbü’l-eşrâf [111]Amasyalı Emîrî Mahmûd Çelebi’nin mu’ârefesiyle Amasya nakîbü’l-eşrâf kâ’im-makâmı oldu.
İki yıl kadar bu mevki’inde muhterem olup 929’da dâr-ı bekâya rihlet etdi. Âlim, âkil, akîdesi pâk, sâf-derûn, müte’abbid bir emîr-i zî-şân idi. Mahdûmları es-Seyyid Mehmed, Abdulkâdir Çelebilerdir. Birâderi Emîr Şerefeddîn Hamza Çelebi de yedi emîrlerden biri idi. Hafîdi şeyhü’l-harem es-Seyyid Mehmed Çelebi’dir.